Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC160A6NGH7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC160A6NGH7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC160A6NGH7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC160A6NGH7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms