Protein–RNA interactions for Protein: A6NGC4

TLCD2, TLC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD2A6NGC4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLCD2A6NGC4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLCD2A6NGC4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLCD2A6NGC4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLCD2A6NGC4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLCD2A6NGC4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD2A6NGC4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLCD2A6NGC4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLCD2A6NGC4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLCD2A6NGC4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TLCD2A6NGC4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLCD2A6NGC4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLCD2A6NGC4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLCD2A6NGC4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD2A6NGC4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TLCD2A6NGC4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLCD2A6NGC4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLCD2A6NGC4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLCD2A6NGC4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLCD2A6NGC4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLCD2A6NGC4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLCD2A6NGC4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLCD2A6NGC4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD2A6NGC4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD2A6NGC4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD2A6NGC4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD2A6NGC4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TLCD2A6NGC4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD2A6NGC4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD2A6NGC4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD2A6NGC4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD2A6NGC4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLCD2A6NGC4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLCD2A6NGC4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms