Protein–RNA interactions for Protein: A6NEV1

PRR23A, Proline-rich protein 23A, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23AA6NEV1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRR23AA6NEV1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRR23AA6NEV1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRR23AA6NEV1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRR23AA6NEV1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRR23AA6NEV1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRR23AA6NEV1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRR23AA6NEV1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRR23AA6NEV1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRR23AA6NEV1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRR23AA6NEV1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRR23AA6NEV1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRR23AA6NEV1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRR23AA6NEV1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRR23AA6NEV1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRR23AA6NEV1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRR23AA6NEV1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms