Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
EME2A4GXA9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EME2A4GXA9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EME2A4GXA9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EME2A4GXA9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EME2A4GXA9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EME2A4GXA9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EME2A4GXA9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EME2A4GXA9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EME2A4GXA9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EME2A4GXA9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EME2A4GXA9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EME2A4GXA9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EME2A4GXA9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EME2A4GXA9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EME2A4GXA9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EME2A4GXA9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EME2A4GXA9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EME2A4GXA9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EME2A4GXA9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EME2A4GXA9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EME2A4GXA9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EME2A4GXA9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms