Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms