Protein–RNA interactions for Protein: A3KN83

SBNO1, Protein strawberry notch homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1A3KN83 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SBNO1A3KN83 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SBNO1A3KN83 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SBNO1A3KN83 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SBNO1A3KN83 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SBNO1A3KN83 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SBNO1A3KN83 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SBNO1A3KN83 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SBNO1A3KN83 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SBNO1A3KN83 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SBNO1A3KN83 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SBNO1A3KN83 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SBNO1A3KN83 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SBNO1A3KN83 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SBNO1A3KN83 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SBNO1A3KN83 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SBNO1A3KN83 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SBNO1A3KN83 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SBNO1A3KN83 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SBNO1A3KN83 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SBNO1A3KN83 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SBNO1A3KN83 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SBNO1A3KN83 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SBNO1A3KN83 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SBNO1A3KN83 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SBNO1A3KN83 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SBNO1A3KN83 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SBNO1A3KN83 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SBNO1A3KN83 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SBNO1A3KN83 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SBNO1A3KN83 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SBNO1A3KN83 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SBNO1A3KN83 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SBNO1A3KN83 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SBNO1A3KN83 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SBNO1A3KN83 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SBNO1A3KN83 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SBNO1A3KN83 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
SBNO1A3KN83 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SBNO1A3KN83 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SBNO1A3KN83 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SBNO1A3KN83 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SBNO1A3KN83 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SBNO1A3KN83 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SBNO1A3KN83 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SBNO1A3KN83 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SBNO1A3KN83 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SBNO1A3KN83 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SBNO1A3KN83 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SBNO1A3KN83 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SBNO1A3KN83 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SBNO1A3KN83 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SBNO1A3KN83 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SBNO1A3KN83 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SBNO1A3KN83 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SBNO1A3KN83 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
SBNO1A3KN83 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SBNO1A3KN83 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SBNO1A3KN83 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SBNO1A3KN83 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
SBNO1A3KN83 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
SBNO1A3KN83 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SBNO1A3KN83 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SBNO1A3KN83 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SBNO1A3KN83 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SBNO1A3KN83 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SBNO1A3KN83 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SBNO1A3KN83 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SBNO1A3KN83 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SBNO1A3KN83 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SBNO1A3KN83 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SBNO1A3KN83 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SBNO1A3KN83 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SBNO1A3KN83 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SBNO1A3KN83 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SBNO1A3KN83 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SBNO1A3KN83 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SBNO1A3KN83 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SBNO1A3KN83 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SBNO1A3KN83 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SBNO1A3KN83 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SBNO1A3KN83 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SBNO1A3KN83 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SBNO1A3KN83 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SBNO1A3KN83 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms