Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
E2F8A0AVK6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E2F8A0AVK6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F8A0AVK6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F8A0AVK6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F8A0AVK6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F8A0AVK6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E2F8A0AVK6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E2F8A0AVK6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E2F8A0AVK6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
E2F8A0AVK6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E2F8A0AVK6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E2F8A0AVK6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
E2F8A0AVK6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
E2F8A0AVK6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms