Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N3

TRBV24-1, T-cell receptor beta variable 24-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV24-1A0A075B6N3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV24-1A0A075B6N3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV24-1A0A075B6N3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV24-1A0A075B6N3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV24-1A0A075B6N3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV24-1A0A075B6N3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV24-1A0A075B6N3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV24-1A0A075B6N3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV24-1A0A075B6N3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV24-1A0A075B6N3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV24-1A0A075B6N3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV24-1A0A075B6N3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV24-1A0A075B6N3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV24-1A0A075B6N3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRBV24-1A0A075B6N3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV24-1A0A075B6N3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV24-1A0A075B6N3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV24-1A0A075B6N3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV24-1A0A075B6N3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV24-1A0A075B6N3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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