Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 GINS1-201ENST00000262460 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 SPRR3-201ENST00000295367 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 TTC32-201ENST00000333610 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 CLEC2A-201ENST00000339766 732 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RNU1-28P-201ENST00000383861 164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RNU1-27P-201ENST00000383869 164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RNU1-1-201ENST00000383925 164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RNVU1-18-201ENST00000384010 164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RNU1-2-201ENST00000384278 164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RNU1-4-201ENST00000384659 164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RNU1-3-201ENST00000384782 164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC022400.3-201ENST00000399449 3810 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC097059.2-201ENST00000414039 592 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RPL12P29-201ENST00000425565 457 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 Z97634.1-203ENST00000435229 471 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RPP21-223ENST00000436442 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AL669970.1-201ENST00000444936 450 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AL359979.1-201ENST00000446145 487 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 784 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC009502.2-201ENST00000452903 766 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RN7SL397P-201ENST00000487309 298 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 IGKV1D-16-201ENST00000492446 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC026787.1-201ENST00000504182 420 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC006499.7-201ENST00000512421 1117 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 OR5G1P-201ENST00000525221 946 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 INTS4-205ENST00000527522 956 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC156455.1-202ENST00000540968 587 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 ZNF826P-202ENST00000542380 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC048337.1-201ENST00000557474 552 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC100826.1-201ENST00000558010 890 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 LINC02152-201ENST00000566208 1281 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AP006565.1-201ENST00000581117 586 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 TSPAN16-205ENST00000592955 927 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC011416.3-201ENST00000603971 355 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 ACTG1P22-202ENST00000605503 859 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 U1.40-201ENST00000610976 164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AL513479.1-201ENST00000611376 585 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 U1.27-201ENST00000615842 164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 MIR6877-201ENST00000620452 64 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 SEM1-223ENST00000623498 582 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 NELFE-214ENST00000625905 111 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 LINC00282-201ENST00000626362 654 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC097493.5-201ENST00000641103 1010 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 SLC6A2-206ENST00000567238 3160 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 TMOD2-202ENST00000435126 1490 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 ZNF383-208ENST00000590503 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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PTGFRP43088 KIF23-201ENST00000260363 3713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 NUDT13-201ENST00000349051 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 FOLH1-213ENST00000533034 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 TTC26-202ENST00000430935 4198 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
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PTGFRP43088 CLDN2-203ENST00000541806 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
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PTGFRP43088 AC104619.3-201ENST00000509116 1387 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTGFRP43088 PTPRB-208ENST00000550358 6583 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTGFRP43088 SKAP2-201ENST00000345317 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC131392.2-201ENST00000505635 4332 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTGFRP43088 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 UBQLN3-201ENST00000311659 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 MRPL1-201ENST00000315567 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CASP5-202ENST00000393141 1488 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LINC01858-201ENST00000564534 1838 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SCGB2A1-201ENST00000244930 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CALCA-202ENST00000361010 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 HMGN1-202ENST00000380747 709 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RNASE1-203ENST00000397970 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SCG5-202ENST00000413748 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 OSBPL10-AS1-201ENST00000417313 475 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 PGAM1P6-201ENST00000425684 747 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AL109659.1-201ENST00000431986 651 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 BX276092.7-201ENST00000433410 623 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC011228.1-201ENST00000439027 757 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC005588.1-201ENST00000439168 162 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RN7SL231P-201ENST00000461840 272 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CREM-237ENST00000488328 1049 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 GNGT2-203ENST00000507680 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LINC02116-201ENST00000509455 493 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 GNGT2-206ENST00000515635 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 IGHVIV-44-1-201ENST00000519334 338 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC011632.1-203ENST00000522914 454 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 GABRB3-205ENST00000545868 1267 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 HNRNPCP3-201ENST00000560385 875 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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