Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ZFHX2-AS1-203ENST00000556354 931 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -19e-11■■□□□ 14.1
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PRPF8Q6P2Q9 XPC-202ENST00000427795 820 ntTSL 211.32□□□□□ -0.63e-6■■□□□ 14.1
PRPF8Q6P2Q9 DOCK5-211ENST00000495236 594 ntTSL 41.87□□□□□ -2.111e-15■■□□□ 14.1
PRPF8Q6P2Q9 MSI2-205ENST00000577241 710 ntTSL 313.24□□□□□ -0.296e-23■■□□□ 14.1
PRPF8Q6P2Q9 ANXA11-206ENST00000447489 750 ntTSL 313.08□□□□□ -0.313e-6■■□□□ 14.1
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PRPF8Q6P2Q9 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.442e-6■■□□□ 14.1
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PRPF8Q6P2Q9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.322e-12■■□□□ 14.1
PRPF8Q6P2Q9 UCKL1-207ENST00000632800 1530 ntTSL 511.59□□□□□ -0.552e-12■■□□□ 14.1
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PRPF8Q6P2Q9 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.523e-8■■□□□ 14.1
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PRPF8Q6P2Q9 MLLT10-211ENST00000471315 319 ntTSL 39.64□□□□□ -0.871e-7■■□□□ 14
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PRPF8Q6P2Q9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.275e-7■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.025e-7■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 EPB41L1-216ENST00000454226 593 ntTSL 311.66□□□□□ -0.541e-7■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 EPB41L1-219ENST00000636016 6665 ntTSL 27.5□□□□□ -1.211e-7■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 MAPK12-204ENST00000467891 2019 ntTSL 522.07■■□□□ 1.125e-8■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.015e-8■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.45e-8■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 TP53I3-206ENST00000470636 317 ntTSL 311.35□□□□□ -0.591e-25■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 DENND1A-205ENST00000462245 739 ntTSL 23.92□□□□□ -1.783e-7■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 ASIC4-204ENST00000473709 613 ntTSL 29.68□□□□□ -0.862e-7■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 PLOD3-206ENST00000454310 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.07□□□□□ -0.321e-6■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-6■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.061e-6■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.071e-6■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 HGS-213ENST00000575078 330 ntTSL 310.35□□□□□ -0.757e-7■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 PRRC2A-211ENST00000484787 756 ntTSL 211.32□□□□□ -0.62e-8■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 MBTPS1-204ENST00000562886 3333 ntTSL 29.63□□□□□ -0.875e-11■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 MBTPS1-202ENST00000561936 708 ntTSL 57.99□□□□□ -1.135e-11■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 MBTPS1-207ENST00000564049 594 ntTSL 47.89□□□□□ -1.155e-11■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 DGKD-212ENST00000489613 890 ntTSL 512.55□□□□□ -0.43e-6■■□□□ 14
PRPF8Q6P2Q9 PRRC2A-205ENST00000464079 451 ntTSL 27.79□□□□□ -1.161e-6■■□□□ 14
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PRPF8Q6P2Q9 RHBDF2-213ENST00000591860 582 ntTSL 311.2□□□□□ -0.624e-6■■□□□ 14
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