Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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