Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB12Q9Y5F1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms