Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms