Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms