Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms