Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms