Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms