Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MAGEC2Q9UBF1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEC2Q9UBF1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms