Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms