Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNFX1Q9P2E3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNFX1Q9P2E3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms