Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms