Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAPAQ9P0L0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAPAQ9P0L0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAPAQ9P0L0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAPAQ9P0L0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAPAQ9P0L0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAPAQ9P0L0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAPAQ9P0L0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAPAQ9P0L0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAPAQ9P0L0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAPAQ9P0L0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAPAQ9P0L0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAPAQ9P0L0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAPAQ9P0L0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms