Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTEL1Q9NZ71 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms