Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms