Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDL2Q9NX52 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms