Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
INTS9Q9NV88 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms