Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms