Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms