Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPRMQ9NS64 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms