Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF4Q9NR80 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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