Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPRD1BQ9NQG5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms