Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms