Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
NPHS2Q9NP85 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms