Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms