Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms