Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSPNQ9HAW4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms