Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOBPQ9H2D6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms