Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms