Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms