Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms