Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms