Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms