Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MXD3Q9BW11 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms