Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF4Q9BUZ4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms