Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2Q9BSQ5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms