Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms