Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms