Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms