Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
RETNLBQ9BQ08 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RETNLBQ9BQ08 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms