Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED2Q99967 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms